Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms