Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms