Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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