Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms