Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms