Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS6Q96GS4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms