Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTV1Q96GA3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms