Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms