Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP13Q92995 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP13Q92995 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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