Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM41Q8WV44 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms