Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms