Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms