Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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