Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms