Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms