Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCDC80Q76M96 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCDC80Q76M96 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCDC80Q76M96 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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