Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACAD11Q709F0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACAD11Q709F0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACAD11Q709F0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACAD11Q709F0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACAD11Q709F0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms