Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms