Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms