Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms