Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms