Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAVIN4Q5BKX8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN4Q5BKX8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms