Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms