Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms