Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

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Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHD9Q3L8U1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHD9Q3L8U1 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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