Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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