Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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