Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM187BQ17R55 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms