Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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RTN1Q16799 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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RTN1Q16799 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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