Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL1Q16048 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMCHL1Q16048 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMCHL1Q16048 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMCHL1Q16048 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMCHL1Q16048 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms