Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
USF2Q15853 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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