Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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NCOA1Q15788 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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NCOA1Q15788 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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NCOA1Q15788 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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NCOA1Q15788 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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