Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms