Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TAF1AQ15573 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TAF1AQ15573 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TAF1AQ15573 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TAF1AQ15573 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TAF1AQ15573 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TAF1AQ15573 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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