Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms