Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEA1Q15075 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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