Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms