Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNIP1Q15025 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms