Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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