Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms