Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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