Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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COL4A6Q14031 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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COL4A6Q14031 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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COL4A6Q14031 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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