Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK13Q14004 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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