Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms