Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CUL1Q13616 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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