Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PWP1Q13610 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PWP1Q13610 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PWP1Q13610 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PWP1Q13610 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PWP1Q13610 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PWP1Q13610 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PWP1Q13610 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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