Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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