Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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