Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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