Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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